■1952年4月
作为文化财保护委员会的附属机构,"奈良文化财研究所"在奈良市春日野町50番地成立。下设总务室、美术工艺研究室、建造物研究室及历史研究室。
■1954年7月
更名为"奈良国立文化财研究所"。
■1960年10月
在奈良市佐纪东町的平城京遗址设置考古发掘办事处。
■1963年4月
设置平城宫遗址考古发掘部。
■1968年6月
日本文化厅成立,本研究所成为其附属机构。
■1970年4月
开设平城宫遗址资料馆
■1973年4月
设置会计课、飞鸟藤原宫遗址考古发掘部及飞鸟资料馆。
■1974年4月
设置总务部(下设总务课、会计课)及地下文化财中心。
■1975年3月
在奈良县高市郡明日香村奥山开设飞鸟资料馆。
■1980年4月
将美术工艺研究室移交给奈良国立博物馆佛教美术资料研究中心。
■1980年4月
将总部办公楼迁至奈良市二条町,合并平城宫遗址考古发掘部与地下文化财中心。
■1988年8月
在橿原市木之本町94-1新建飞鸟藤原宫遗址考古发掘部办公楼。
■2001年4月
成为"独立行政法人文化财研究所 奈良文化财研究所"。
■2007年4月
成为"独立行政法人国立文化财机构 奈良文化财研究所"。